Sources :
Georges Morell, Autour des mots. Le plus court chemin entre la typographie et vous.
Adolphe V. Thomas et Michel de Toro, Dictionnaire des difficultés de la langue française.
TLFi : Trésor de la langue Française informatisé, http://www.atilf.fr/tlfi, ATILF – CNRS & université de Lorraine.
Emploi du trait d’union pour les préfixes en français, Wikipédia.
Office québécois de la langue française https://vitrinelinguistique.oqlf.gouv.qc.ca/.
Aurel Ramat, Romain Muller, Le Ramat européen de la typographie.
Jean-Pierre Lacroux, Orthotypographie. Orthographe et typographie françaises.

Anti

Les mots composés avec le préfixe anti s’écrivent sans tiret. Font exception les composés dont le second élément débute par un i (1), les composés de trois éléments (2), quelques noms géographiques (3), les composés dédoublant le préfixe anti (4) ainsi que les composés dans lesquels le second élément est un nom propre (5) ou un sigle (6).
Ex. : antiaérien, antisémite, anticorps.
Mais à l’inverse : anti-infectieux (1), anti-franc-maçon (2) ou la chaîne de montagnes marocaines de l’Anti-Atlas (3), un anti-anticorps (4), une manifestation anti-FMI (6).

Auto

Les composés avec auto s’écrivent sans tiret à l’exception des mots commençant par un i, un u ou un o.
Ex. : autonettoyant mais auto-orientable, une auto-infection.

Bi

Les composés avec bi s’écrivent sans tiret.
Ex. : bimestriel, bicentenaire.

Bio

Les composés formés avec bio s’écrivent généralement sans tiret. Toutefois, afin d’éviter des problèmes de prononciation, bio est suivi d’un tiret lorsqu’il précède un mot qui commence par les voyelles i ou u. Le tiret est aussi préférable lorsque le second élément commence par un o.
Ex. : bioalimentaire mais bio-industrie, bio-usine, bio-ordinateur.

Co

Le préfixe co se joint au composé sans tiret. Le tiret est obligatoire lorsque le second élément commence par un i (sauf coïncider, coïncidence, coïnculpé, coïndivisaire et coïntéressé, dont le tréma justifie la soudure) ou un u (1) ainsi que lorsque le second élément est un nom composé dont les éléments sont déjà unis par un trait d’union (2).
Ex. : un coaccusé, une cooccurrence, mais une co-intervention (1), un co-usufrutier (1), co-porte-parole (2).

Contre

La plupart des composés avec contre s’écrivent avec un tiret.
Liste des exceptions dans le Dictionnaire des difficultés de la langue française, p. 102 : contrebalancer, contrebande, contrebandier, en contrebas, contrebasse, contrebatterie, contrebattre, contrecarrer, contrechâssis, contreclef, à contrecœur, contrecoup, contredanse, contredire, sans contredit, contrefaçon, contrefacteur, contrefaire, contrefait, contrefort, contremaître, contremandement, contremander, contremarche, contremarque, contrepartie, contrepèterie, contrepoids, contrepoint, contrepoison, contreprojet, contreproposition, contreseing, contresens, contresignataire, contresigner, contretemps, contretype, contrevenant, contrevenir, contrevent, contrevérité.

Demi

Le préfixe demi est toujours lié au complément avec un tiret.
Ex. : une demi-heure, un demi-litre, un demi-solde.

Extra

Le préfixe extra signifiant extérieur à est soudé au complément (1) sauf si le second élément débute par un i un u ou un a (2). Lorsque le préfixe extra est l’abréviation de extraordinairement1, il est généralement joint au complément par un tiret (3).
Ex. : extrajudiciaire (1), extraparlementaire (1), une relation extraconjugale (1), mais extra-utérin (2), extra-atmosphérique (2), des petits pois extra-fins (3).
Exception : extra-muros étant une expression latine reste composé avec un tiret.

Hors

Pris substantivement, les composés avec hors prennent un tiret.
Ex. : un hors-série, un hors-bord, un hors-jeu mais être hors jeu.

Infra

Les composés avec infra se composent sans tiret sauf si le second élément débute par une voyelle.
Ex. : infrarouge, infrason, infrastructure mais infra-axillaire, infra-intellectuel.

Inter

Le préfixe inter est toujours soudé au mot qui le suit.
Ex. : interurbain, interrégional.

Intra

Les composés avec intra s’écrivent sans tiret sauf si le complément débute par une voyelle.
Ex. : intraveineux mais intra-oculaire, intra-utérin.

Mi

Le préfixe mi est toujours lié au complément avec un tiret.
Ex. : une mi-temps, à la mi-août.

Micro

Les composés avec micro s’écrivent sans tiret sauf si le complément débute par un i, un o ou un u.
Ex. : microbiologie, microéconomique, le salon de la microédition mais micro-informatique, micro-ordinateur.

Néo

Le préfixe néo est soudé à l’élément suivant sauf lorsque le second élément commence par un i ou un u (1) ou qu’il s’agit d’un gentilé/adjectif correspondant (2).
Ex. : néocapitalisme, néonatalogie mais néo-impressionnisme (1), néo-zélandais (2).

Non

Les composés avec non s’écrivent sans tiret devant un adjectif, un participe passé ou un adverbe mais avec tiret devant un nom.
Ex. : les pays non alignés mais les non-alignés ; un non-combattant mais une unité non combattante.

Para

Le préfixe para se joint sans tiret sauf si le complément commence par un i, un u un a ou un y.
Ex. : parapublic mais para-aortique.

Pluri

Le préfixe pluri se soude toujours à l’élément suivant sauf s’il débute par un i.
Ex. : pluridisciplinaire, pluriethnique mais pluri-institutionnel.

Post

Le préfixe post se joint en général au nom sans tiret (1) sauf si le complément commence par un t (2), dans certaines expressions composées latines (3) ou si le complément est un nom propre (4).
Ex. : postsocialiste (1), postindustriel (1), mais post-traumatique (2), post-scriptum (3), post-Renaissance (4).

Pré

Le préfixe pré se joint au nom sans tiret sauf si le complément est un nom propre ou un sigle.
Ex. : préromain, préétablir mais la période pré-ONU.

Pseudo

Les éléments sont généralement soudés quand pseudo signifie est semblable à (1) ; le tiret s’impose lorsque le second élément débute par un i ou un u (2) ou dans les composés dans lesquels pseudo exprime une idée de fausseté (3).
Ex. : pseudobulbaire (1), un pseudovecteur (1), un pseudoparasite (1) mais pseudo-inflammation (2), pseudo-philosophie (3), pseudo-science (3).

Quasi

Le composé prend un tiret si relié à un nom ; n’en prend pas si relié à un adjectif ou un adverbe.
Ex. : une quasi-certitude, la quasi-totalité mais c’est quasi impossible, une grève quasi générale.

Re ou ré

Le préfixe se joint au composé sans tiret. On emploie re lorsque le composé débute par une consonne, ré devant une voyelle, re ou ré devant la lettre h. Devant un a ou un é, le préfixe se réduit parfois à r.
Ex. : repartir ; réhabiliter mais rehausser ; réassurance mais rajuster.

Rétro

Les composés avec rétro s’écrivent soudés sauf si le second élément commence par un i ou un u.
Ex. : rétroaction, rétrograder mais rétro-impulsion, rétro-ingénierie.

Semi

Le préfixe semi est toujours lié au complément avec un tiret.
Ex. : semi-automatique, semi-remorque, semi-liberté.

Socio

Le préfixe socio se soude au composé sauf s’il commence par un i ou un u.
Ex. : socioéducatif.

Sous

Les mots composés avec sous s’écrivent avec un tiret.
Ex. : sous-alimentation, un sous-verre.

Super

Les composés avec super s’écrivent en général sans tiret.
Ex. : supermarché.

Supra

Les composés avec supra s’écrivent sans tiret sauf si le second élément débute par une voyelle.
Ex. : supraconducteur, supranational, mais supra-optique.

Sur

Les composés avec sur ne prennent pas de tiret.
Ex. : surfacturé, un surtitre.

Télé

Les composés avec télé s’écrivent en un seul mot mais peuvent prendre un tiret lorsque le second élément débute par un é ou un e.
Ex. : téléobjectif, téléachat mais téléenseignement ou télé-enseignement.

Trans

Les composés avec trans s’écrivent toujours sans tiret, même si le composé débute par la lettre s.
Ex. : transsaharien ou transsubstantiation.

Ultra

Les composés avec ultra s’écrivent en un seul mot sauf si le second élément débute par une voyelle.
Ex. : ultrachic, ultracourt, ultraléger mais ultra-aigu, ultra-irritant.

Vice

Les composés avec vice s’écrivent avec un tiret.
Ex. : la vice-présidente.